El Instituto de Economía busca generar conocimiento mediante investigaciones de alta calidad en base a tres ejes:
a) la explicación de las problemáticas abordadas según vertientes de pensamiento económico diversas;
b) el relacionamiento con la sociedad y
c) el fomento activo a la formación permanente de estudiantes e investigadores.
Actualmente la investigación se organiza en base a los siguientes equipos: agroindustria, comercio internacional, coyuntura económica, desarrollo, empleo e ingresos e historia económica.